Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 AL035420.1-202ENST00000450129 357 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 BLID-201ENST00000560104 862 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 TMC5-208ENST00000564959 2434 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 ADI1-202ENST00000382093 3870 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 MAMDC2-AS1-202ENST00000414515 2097 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 AC020978.6-201ENST00000571197 3177 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 FBXW7-201ENST00000263981 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 FAM122C-201ENST00000370784 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 APOL4-212ENST00000616056 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 CD86-209ENST00000493101 1572 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 NR1H4-206ENST00000548884 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 HSD17B4-212ENST00000509514 2314 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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HTR4Q13639 SPATS2-222ENST00000552918 2993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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HTR4Q13639 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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HTR4Q13639 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 TMSB15B-208ENST00000620307 2286 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 ERRFI1-202ENST00000467067 2097 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 GINS4-201ENST00000276533 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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HTR4Q13639 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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HTR4Q13639 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 ZIM3-201ENST00000269834 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 CAST-228ENST00000509903 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HTR4Q13639 AL445218.1-202ENST00000427695 845 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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