Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 AC011753.2-201ENST00000425576 610 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 DIRC3-AS1-201ENST00000452813 557 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 MRPS33-203ENST00000467334 622 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 AC068647.2-202ENST00000485020 390 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 AC008868.1-201ENST00000509786 737 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 AC040934.1-201ENST00000523101 513 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 AC091096.2-201ENST00000523284 587 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 AL109628.1-201ENST00000556877 366 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 AC091304.4-201ENST00000565703 620 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 AC126323.5-201ENST00000569913 592 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 AC010531.4-201ENST00000570286 576 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 AC016383.1-201ENST00000582700 714 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 AL591222.2-201ENST00000604443 754 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 AC127071.2-201ENST00000623293 527 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
AP3M2P53677 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 ASPH-204ENST00000389204 1290 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 BBOF1-202ENST00000463558 550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 LINC01098-201ENST00000507870 1034 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AP002004.1-206ENST00000532441 876 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AC090527.1-201ENST00000557965 431 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AC097467.3-215ENST00000609486 793 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AC097467.3-214ENST00000610249 843 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AL513283.1-203ENST00000640010 891 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 FAM20A-207ENST00000619787 2798 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 IAPP-205ENST00000542023 2015 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms