Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TCOF1Q13428 AURKA-203ENST00000371356 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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TCOF1Q13428 ITSN2-202ENST00000361999 5814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 ZNF888-202ENST00000638862 4195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
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TCOF1Q13428 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
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TCOF1Q13428 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 HRH1-201ENST00000397056 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 AC135012.3-201ENST00000599841 4039 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
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