Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 ATP2C1-208ENST00000504948 4714 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 UGT2B25P-201ENST00000511504 1586 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 OR10K2-202ENST00000641042 3023 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 AC112719.2-201ENST00000501239 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 SLC35E3-202ENST00000398004 17791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 AC244034.2-201ENST00000562504 509 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 AMOT-202ENST00000371958 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 NAV2-203ENST00000396085 11000 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 NUMB-217ENST00000555738 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 FAM20A-207ENST00000619787 2798 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 GPR19-203ENST00000540510 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 LINC01105-203ENST00000431188 3329 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 BX119917.1-201ENST00000432517 502 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 PGBD4P1-201ENST00000473644 407 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 GBA3-201ENST00000503442 1232 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 RPL41P2-201ENST00000544920 409 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 BTN3A3-201ENST00000244519 3002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 PHACTR2-201ENST00000305766 1851 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 CNPY1-201ENST00000321736 2378 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 KRBOX1-202ENST00000418176 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 SMN2-214ENST00000626847 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 NHLRC3-201ENST00000379599 3275 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 KCNMB2-201ENST00000358316 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
COG3Q96JB2 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms