Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TCOF1Q13428 RBM12B-202ENST00000517700 6001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TCOF1Q13428 AC087280.2-201ENST00000637205 4822 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TCOF1Q13428 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TCOF1Q13428 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TCOF1Q13428 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TCOF1Q13428 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TCOF1Q13428 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TCOF1Q13428 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TCOF1Q13428 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TCOF1Q13428 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TCOF1Q13428 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TCOF1Q13428 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TCOF1Q13428 PVT1-214ENST00000522875 922 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TCOF1Q13428 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TCOF1Q13428 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TCOF1Q13428 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TCOF1Q13428 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TCOF1Q13428 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TCOF1Q13428 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TCOF1Q13428 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TCOF1Q13428 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TCOF1Q13428 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TCOF1Q13428 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TCOF1Q13428 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TCOF1Q13428 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TCOF1Q13428 MAPK10-280ENST00000641166 2684 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
TCOF1Q13428 TMEM108-201ENST00000321871 3744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TCOF1Q13428 LSAMP-205ENST00000490035 9446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TCOF1Q13428 BMPR1A-201ENST00000372037 11255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 ZNF812P-202ENST00000536819 1890 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 FGFR2-213ENST00000369061 3803 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 SMG1P4-203ENST00000517529 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 MYOM1-202ENST00000356443 5847 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 OR2T6-202ENST00000641644 4670 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 CCR8-201ENST00000326306 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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TCOF1Q13428 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 AC138811.1-201ENST00000569096 361 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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TCOF1Q13428 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 PROM1-206ENST00000505450 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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TCOF1Q13428 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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TCOF1Q13428 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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TCOF1Q13428 FAM19A2-211ENST00000550003 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 ZNF791-202ENST00000446165 6412 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 SP4-201ENST00000222584 6126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 UTY-202ENST00000331397 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 NRP1-207ENST00000374875 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 LINC01013-203ENST00000443303 569 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 IGHVIII-13-1-201ENST00000517613 291 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
TCOF1Q13428 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
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