Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 SUPT16H-201ENST00000216297 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 CEP41-219ENST00000616628 3315 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 OSTN-AS1-201ENST00000430375 515 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 PTTG3P-201ENST00000521862 606 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 CELF2-209ENST00000631460 5538 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 SCAND2P-201ENST00000348993 8975 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 AC007066.2-201ENST00000561961 1993 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 ARMCX3-207ENST00000537169 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 BCLAF3-203ENST00000379687 6528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 HECTD4-202ENST00000377560 15759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 GCNT3-209ENST00000560585 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 SLC14A2-203ENST00000586448 3540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 AC004593.1-201ENST00000446246 798 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 AC008770.1-202ENST00000495324 516 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 DGKK-201ENST00000611977 7407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 ZHX3-214ENST00000559234 6296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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COL4A6Q14031 AC107884.1-207ENST00000504206 4433 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 SLC22A9-201ENST00000279178 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 SCRN3-201ENST00000272732 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 AURKA-203ENST00000371356 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
COL4A6Q14031 DAZ2-206ENST00000382440 4119 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 MDM2-202ENST00000258149 12633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 PAN2-202ENST00000425394 5372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 KCNMB2-201ENST00000358316 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 LINC00184-201ENST00000429269 2270 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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COL4A6Q14031 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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COL4A6Q14031 DOCK5-201ENST00000276440 10075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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COL4A6Q14031 AMPD3-209ENST00000529507 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 LINC02073-201ENST00000588341 2845 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 FLJ21408-201ENST00000499939 2594 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 CHIC1-201ENST00000373502 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 LRRC4C-202ENST00000527150 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 GAPVD1-201ENST00000265956 2667 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 SLC7A2-204ENST00000494857 7622 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 WDR7-202ENST00000357574 7213 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 PPP3R2-201ENST00000374806 3387 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 HRH1-201ENST00000397056 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 PDLIM5-219ENST00000514743 3356 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 AC007938.1-201ENST00000562524 2902 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 AL353807.3-201ENST00000500626 2505 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 EZH1-222ENST00000592743 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 SERPINB8-203ENST00000397985 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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