Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAMTA1Q9Y6Y1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms