Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00312Q9Y6C7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms