Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
COL4A3BPQ9Y5P4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL4A3BPQ9Y5P4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL4A3BPQ9Y5P4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL4A3BPQ9Y5P4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL4A3BPQ9Y5P4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL4A3BPQ9Y5P4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL4A3BPQ9Y5P4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL4A3BPQ9Y5P4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL4A3BPQ9Y5P4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COL4A3BPQ9Y5P4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COL4A3BPQ9Y5P4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms