Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms