Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms