Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX2IPQ9Y2D8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms