Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms