Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms