Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CEP164Q9UPV0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CEP164Q9UPV0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CEP164Q9UPV0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
CEP164Q9UPV0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CEP164Q9UPV0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CEP164Q9UPV0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CEP164Q9UPV0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CEP164Q9UPV0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CEP164Q9UPV0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CEP164Q9UPV0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CEP164Q9UPV0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CEP164Q9UPV0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CEP164Q9UPV0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CEP164Q9UPV0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CEP164Q9UPV0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CEP164Q9UPV0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
CEP164Q9UPV0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CEP164Q9UPV0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CEP164Q9UPV0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CEP164Q9UPV0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
CEP164Q9UPV0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
CEP164Q9UPV0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
CEP164Q9UPV0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CEP164Q9UPV0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CEP164Q9UPV0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CEP164Q9UPV0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CEP164Q9UPV0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CEP164Q9UPV0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CEP164Q9UPV0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CEP164Q9UPV0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms