Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms