Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX7Q9UNH6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNX7Q9UNH6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNX7Q9UNH6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNX7Q9UNH6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNX7Q9UNH6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNX7Q9UNH6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNX7Q9UNH6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX7Q9UNH6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX7Q9UNH6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX7Q9UNH6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX7Q9UNH6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX7Q9UNH6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX7Q9UNH6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms