Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMX5

NENF, Neudesin, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NENFQ9UMX5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NENFQ9UMX5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NENFQ9UMX5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NENFQ9UMX5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NENFQ9UMX5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NENFQ9UMX5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NENFQ9UMX5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NENFQ9UMX5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NENFQ9UMX5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NENFQ9UMX5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NENFQ9UMX5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NENFQ9UMX5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NENFQ9UMX5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NENFQ9UMX5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NENFQ9UMX5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NENFQ9UMX5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NENFQ9UMX5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NENFQ9UMX5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NENFQ9UMX5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NENFQ9UMX5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms