Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGA11Q9UKX5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA11Q9UKX5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms