Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms