Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms