Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms