Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.8
PARP4Q9UKK3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PARP4Q9UKK3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms