Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms