Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MSRAQ9UJ68 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MSRAQ9UJ68 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MSRAQ9UJ68 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MSRAQ9UJ68 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSRAQ9UJ68 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSRAQ9UJ68 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSRAQ9UJ68 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSRAQ9UJ68 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms