Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPA4Q9UI42 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms