Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX1-2Q9UD57 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX1-2Q9UD57 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX1-2Q9UD57 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX1-2Q9UD57 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX1-2Q9UD57 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX1-2Q9UD57 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX1-2Q9UD57 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX1-2Q9UD57 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX1-2Q9UD57 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX1-2Q9UD57 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX1-2Q9UD57 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX1-2Q9UD57 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms