Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS5

GABBR1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABBR1Q9UBS5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GABBR1Q9UBS5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABBR1Q9UBS5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms