Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL42Q9P2K6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms