Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms