Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ71

RTEL1, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1Q9NZ71 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1Q9NZ71 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms