Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA2D2Q9NY47 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms