Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms