Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMILIN3Q9NT22 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms