Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms