Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TM7SF3Q9NS93 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms