Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms