Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP87

POLM, DNA-directed DNA/RNA polymerase mu, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLMQ9NP87 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
POLMQ9NP87 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLMQ9NP87 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLMQ9NP87 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
POLMQ9NP87 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
POLMQ9NP87 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLMQ9NP87 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLMQ9NP87 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLMQ9NP87 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLMQ9NP87 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLMQ9NP87 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLMQ9NP87 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLMQ9NP87 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLMQ9NP87 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLMQ9NP87 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POLMQ9NP87 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLMQ9NP87 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POLMQ9NP87 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POLMQ9NP87 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLMQ9NP87 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLMQ9NP87 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLMQ9NP87 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POLMQ9NP87 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLMQ9NP87 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POLMQ9NP87 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLMQ9NP87 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLMQ9NP87 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLMQ9NP87 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLMQ9NP87 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLMQ9NP87 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLMQ9NP87 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLMQ9NP87 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLMQ9NP87 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
POLMQ9NP87 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLMQ9NP87 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLMQ9NP87 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLMQ9NP87 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms