Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4F12Q9HCS2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms