Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF408Q9H9D4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF408Q9H9D4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF408Q9H9D4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF408Q9H9D4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF408Q9H9D4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF408Q9H9D4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF408Q9H9D4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF408Q9H9D4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF408Q9H9D4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF408Q9H9D4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF408Q9H9D4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF408Q9H9D4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF408Q9H9D4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF408Q9H9D4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF408Q9H9D4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF408Q9H9D4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF408Q9H9D4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF408Q9H9D4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms