Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SCAF1Q9H7N4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCAF1Q9H7N4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCAF1Q9H7N4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCAF1Q9H7N4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCAF1Q9H7N4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCAF1Q9H7N4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCAF1Q9H7N4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCAF1Q9H7N4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCAF1Q9H7N4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCAF1Q9H7N4 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAF1Q9H7N4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAF1Q9H7N4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAF1Q9H7N4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAF1Q9H7N4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAF1Q9H7N4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAF1Q9H7N4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAF1Q9H7N4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAF1Q9H7N4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAF1Q9H7N4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAF1Q9H7N4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAF1Q9H7N4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAF1Q9H7N4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAF1Q9H7N4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAF1Q9H7N4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAF1Q9H7N4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAF1Q9H7N4 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAF1Q9H7N4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAF1Q9H7N4 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAF1Q9H7N4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAF1Q9H7N4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAF1Q9H7N4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAF1Q9H7N4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAF1Q9H7N4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms