Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms