Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00597Q9H2U6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00597Q9H2U6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00597Q9H2U6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00597Q9H2U6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00597Q9H2U6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00597Q9H2U6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00597Q9H2U6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00597Q9H2U6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00597Q9H2U6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00597Q9H2U6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00597Q9H2U6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00597Q9H2U6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms