Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF39Q9H2S5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF39Q9H2S5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF39Q9H2S5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF39Q9H2S5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF39Q9H2S5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF39Q9H2S5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF39Q9H2S5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF39Q9H2S5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF39Q9H2S5 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF39Q9H2S5 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF39Q9H2S5 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF39Q9H2S5 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF39Q9H2S5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF39Q9H2S5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF39Q9H2S5 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF39Q9H2S5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF39Q9H2S5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF39Q9H2S5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF39Q9H2S5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF39Q9H2S5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF39Q9H2S5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF39Q9H2S5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF39Q9H2S5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RNF39Q9H2S5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RNF39Q9H2S5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 AC022679.2-201ENST00000522186 813 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 LINC01221-201ENST00000432488 662 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 AC016747.2-203ENST00000606876 289 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 AC005066.1-201ENST00000613582 1007 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 ETFRF1-209ENST00000556885 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 KCNMB3-201ENST00000314235 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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