Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDCBP2Q9H190 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms