Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCOLN1Q9GZU1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCOLN1Q9GZU1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MCOLN1Q9GZU1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCOLN1Q9GZU1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCOLN1Q9GZU1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCOLN1Q9GZU1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MCOLN1Q9GZU1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCOLN1Q9GZU1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCOLN1Q9GZU1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCOLN1Q9GZU1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCOLN1Q9GZU1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCOLN1Q9GZU1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCOLN1Q9GZU1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCOLN1Q9GZU1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCOLN1Q9GZU1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCOLN1Q9GZU1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCOLN1Q9GZU1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCOLN1Q9GZU1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCOLN1Q9GZU1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCOLN1Q9GZU1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms