Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR88Q9GZN0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPR88Q9GZN0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPR88Q9GZN0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPR88Q9GZN0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPR88Q9GZN0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPR88Q9GZN0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPR88Q9GZN0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPR88Q9GZN0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPR88Q9GZN0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GPR88Q9GZN0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPR88Q9GZN0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GPR88Q9GZN0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPR88Q9GZN0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GPR88Q9GZN0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPR88Q9GZN0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPR88Q9GZN0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPR88Q9GZN0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPR88Q9GZN0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms