Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
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