Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NLRP1Q9C000 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms