Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP2-4Q9BYR9 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms